در برخی موارد دندان های که معالجه شده اند دچار مشکلاتی از قبیل ضایعه انتهای ریشه، حوادث حین درمان ریشه یا عدم درمان کامل به دلیل مشکلات آناتومیک دندانی می شوند. در این موارد پس از بررسی دندان درصورتیکه امکان اصلاح مشکلات مذکور وجود داشته باشد، اقدام به درمان ریشه مجدد دندان می شود. در مواردی نیز علیرغم موفق بودن درمان ریشه ابتدایی به دلیل ترمیم نامناسب تاجی یا باز بودن روی کانال های دندان بیش از ۲ هفته نیاز به درمان ریشه مجدد وجود دارد.

اصول کار مانند درمان اولیه است. ولی در کلی میزان موفقیت درمان ریشه مجدد کمتر از درمان اولیه است. همچنین درمان مجدد ریشه به دلیل مشکلات احتمالی ایجاد شده در ساختار ریشه همواره دشوارتر است. به همین دلیل بهتر است درمان ریشه مجدد توسط متخصص درمان ریشه (اندودونتیست) انجام گیرد. بعد از اتمام درمان ریشه مجدد، رادیوگرافی های دوره ای (هر ۶ ماه به مدت ۲ سال) جهت کنترل نتایج درمان الزامی است.