این درمان زمانی انجام می شود که ناحیه انشعاب ریشه ها (فورکا) دچار مشکلی است که با روش های مرسوم قابل درمان نیست و از طرفی دندان قابل نگهداری می باشد. به این صورت که دندان از وسط و از ناحیه فورکا در قسمت تاج ریشه به دو نیم تقسیم می شود و هر دو قسمت حفظ و بازسازی می شود. به این ترتیب امکان نگهداری و رعایت بهداشت دندان برای فرد میسر می شود. این درمان در دندان های آسیاب بزرگ فک پایین که معیارهای لازم را داشته باشد قابل انجام است.

جراحی قطع انتهای ریشه که به نام های Root end filling یا Retrograde root canal treatment نیز شناخته می شود. در این درمان روی انتهای ریشه جراحی صورت می گیرد، به طوریکه نوک ریشه قطع و خارج شده و با تهیه حفره در انتهای ریشه باقیمانده، با یک ماده زیست سازگار پر شده و ریشه کاملا مسیل می شود.

مواردی که نیاز به جراحی انتهای ریشه است:

• زمانیکه بعد از درمان ریشه موفق دندان، التهاب یا عفونت در ناحیه استخوانی اطراف نوک ریشه پایدار باقی بماند.
• زمانیکه رسوبات کلسیم در انتهای ریشه وجود دارد و امکان رسیدن تا نوک ریشه با وسایل معمول نیست.

• زمانیکه به علت درمانهایی از قبیل پست و روکش امکان دسترسی به ریشه و رفع ضایعه از ناحیه تاج دندان وجود ندارد.